Mnogi ljudi poznaju sliku umjetnika Ilije Repina "Ivan Grozni i njegov sin Ivan 16. studenog 1581." koja prikazuje pokajanje kralja koji je nanio smrtni udarac. Pitanja o tome je li Ivan Vasilijevič bio ubojica i je li kriv za smrt kneza i dalje ostaju neriješena. Misterija smrti sina Ivana IV još je jedna neriješena misterija.
U spisima papinskog legata Antonija Pasevina, koji je tada bio na dvoru Ivana Groznog, naznačeno je da je ruski monarh suprugu potonjeg pronašao u sobama svoga sina Elena u donjem ruhu. U to je vrijeme Elena bila trudna i nije očekivala da će netko ući u nju. Ivan IV pao je od bijesa, snažno je pretukao snahu s osobljem, uslijed čega je imala pobačaj. U to vrijeme ulazi Tsarevich Ivan i, vidjevši oca kako tuče Elenu, intervenira zbog njegove žene. Kralj u naletu bijesa naleti na sina i udari ga po glavi palicom. Udarac je pao u hram i pokazalo se da je kobno, nekoliko dana kasnije umre sin Ivana Groznog.
1963. sovjetski znanstvenici proveli su istraživanje kostiju Ivana IV i njegova sina Ivana. Prema njihovim rezultatima utvrđeno je da je u ostacima pronađena velika količina žive. Odakle bi ta supstanca mogla doći, znanstvenici su mogli samo nagađati.
Istodobno, lubanja princa u vrijeme ekshumacije bila je u lošem stanju zbog propadanja koštanog tkiva. Navedeni razlog nije omogućio potvrdu klasične verzije Ivanove smrti od udarca. Međutim, kosa pokojnika bila je očuvana u dobrom stanju, a istraživači nisu pronašli tragove krvi na njima, što je posredno pobijalo ovu verziju smrti.
Može se pretpostaviti da je Ivan, kao i njegov otac Ivan IV, netko otrovao, a u protivnom kako se može objasniti ogromna količina žive u ostacima kraljevskih osoba.
Možda je udar carskog štaba po glavi kneza, ali to nije bio razlog Ivanove smrti, već se poklopilo samo s trenutkom kada je otrov, nakupljen u tijelu kraljevog sina, dao svoj smrtonosni učinak.
