Treća sezona američke znanstvenofantastične televizijske serije "Vrlo tajno", koja je obuhvatila 24 epizode, započela je 22. rujna 1995. i trajala do 17. svibnja 1996. Emisiju je izveo Fox. Serija je nastavila da pripovijeda posebne agente Federalnog istražnog biroa (FBI - Fox Mulder (David Duchovny)) i Dani Scully (Gillian Anderson). Glavni likovi istražuju slučajeve paranormalnih i tajanstvenih pojava, poznatijih kao slučajeve s pečatom "X".
Sezona je završila nizom scenarija koji su počeli već drugu sezonu i uveli nekoliko novih elemenata priče. Glavna pripovijest usredotočena je na zavjeru koja nastoji prikriti video obdukciju vanzemaljaca koju je kupio Mulder, tragajući za Scullyjevim ubojicom njegove sestre i misterijom koja okružuje gospodina X (Stephen Williams). Zaplet u treću sezonu prvi put su pogodili takve likove kao što su Prvi stariji (Don Sec. Williams) i virus crnaca. Uz to, ove sezone predstavlja širok spektar "čudovišta tjedna": epizode sadrže neovisne priče i ne utječu na opću mitologiju serije.
Sezona je premašila ocjene prethodne dvije. Premijerna epizoda "Blagoslovljeni put" debitirala je s Nielsenovom ocjenom od 19, 94 milijuna gledatelja, što je udvostručilo premijeru prethodne sezone. Tijekom emisija gledanost je neprestano premašila 15 milijuna gledatelja, što ga čini jednom od najpopularnijih televizijskih serija na američkoj televiziji u sezoni 1995-1996. Sezona je dobila uglavnom pozitivne kritike televizijskih kritičara i osvojila je pet nagrada Emmy. Mnoge epizode koje je napisao scenarist Darin Morgan, posebno, "Posljednji ostatak Clydea Brackmana" i "Joe Chang iz svemira", dobili su kritiku kao jednu od najboljih u seriji. Morgan je napustio seriju nakon što je završio sezonu 3 zbog svoje nesposobnosti da drži korak s dinamičnom prirodom emisije. Vratio se tek u desetoj i jedanaestoj sezoni.
priča
Agent FBI-ja Fox Mulder pronađen je napola mrtav u pustinji nakon što je Pušač naredio vojsci da zapali automobil s dokazima znanstvenih eksperimenata, ne znajući da je Mulder unutra. Navajo Indijanac, Albert Gostin, vraća Fox Mulder u život. U međuvremenu, Scully istražuje moguću uključenost u program iskorjenjivanja malih boginja prije genetskih eksperimenata na ljudima. Otkrila je kako je nacistički znanstvenik koji je pobjegao u Sjedinjene Države nakon Drugog svjetskog rata eksperimentirao s Paperclip eksperimentirajući s ciljem stvaranja hibrida ljudi i vanzemaljca. Kao rezultat toga, Scully je ubijena i slučajno je ubila njezinu sestru Melissu, koju je zbunila sama Deina.
Ispitujući dokaze o obdukciji vanzemaljaca, Mulder ide tragom klasificiranog državnog željezničkog prijevoza hibrida čovjeka-vanzemaljaca. Fox uspijeva ući u jedan od tih automobila, gdje je gotovo umro od ruke stražara Sindikata. Međutim, informatičar gospodin X će ga spasiti. Scully u međuvremenu odlazi grupi žena koje su također otete slične njoj i upoznaje drugog člana Sindikata, poznatog kao Prvi stariji, koji tvrdi da je bila smještena u sličan kočiji tijekom otmice i da je postala žrtva eksperimenata japanskih znanstvenika.
Posada francuskog broda za spašavanje, koja s morskog dna pokušava podići podmornicu razdoblja Drugog svjetskog rata, postaje žrtva radijacije. Jedina iznimka je ronilac koji se zarazio parazitom koji je otkriven u podmornici. Ovaj izvanzemaljski virus, koji kontrolira tijela žrtava, na kraju je zarobio tijelo Alexa Kryceka, kojeg je Fox Mulder krenuo u potragu i uzeo pod njegov uhićenje. Rezultat toga je da je zaraženi Krycek smješten u raketnu minu, koja je korištena za skrivanje NLO-a, a parazit je napustio njegovo tijelo. U međuvremenu, Scully uspijeva pronaći Louisa Cardinala, čovjeka odgovornog za ubojstvo njezine sestre.
